Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms