Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms