Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VN1R3Q9BXE9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms