Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SSBP4Q9BWG4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms