Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCMBPQ9BTE3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms