Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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SPOCK3Q9BQ16 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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