Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms