Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCARF2Q96GP6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms