Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLIP3Q96DZ5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLIP3Q96DZ5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms