Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HDAC11Q96DB2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms