Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMIGD2Q96BF3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms