Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCLNQ969V3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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