Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTTNBP2Q8WZ74 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms