Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DNAJA4Q8WW22 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms