Protein–RNA interactions for Protein: Q8N323

NXPE1, NXPE family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE1Q8N323 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NXPE1Q8N323 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NXPE1Q8N323 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms