Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TCF23Q7RTU1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TCF23Q7RTU1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TCF23Q7RTU1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TCF23Q7RTU1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TCF23Q7RTU1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TCF23Q7RTU1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TCF23Q7RTU1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms