Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRIG3Q6UXM1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms