Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPPQ6IPU0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms