Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTDC1Q4AE62 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms