Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GEN1Q17RS7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEN1Q17RS7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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