Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYT16Q17RD7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms