Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PTPRNQ16849 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRNQ16849 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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