Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPROQ16827 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPROQ16827 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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