Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SGCAQ16586 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SGCAQ16586 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SGCAQ16586 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SGCAQ16586 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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