Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RPE65Q16518 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPE65Q16518 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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