Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP3Q15836 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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