Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP10Q15642 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIP10Q15642 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms