Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRD3Q15059 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms