Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK13Q14004 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK13Q14004 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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