Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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PKP1Q13835 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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PKP1Q13835 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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