Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SHROOM2Q13796 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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