Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTCH1Q13635 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTCH1Q13635 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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