Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GRIK2Q13002 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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