Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXC1Q12948 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FOXC1Q12948 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FOXC1Q12948 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXC1Q12948 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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