Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAF2Q12933 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms