Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC15Q0P6D6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms