Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GOLGA3Q08378 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA3Q08378 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms