Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LTBQ06643 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBQ06643 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms