Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPB1Q06547 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms