Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
REG3AQ06141 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms