Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 416.9 ms