Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUCB1Q02818 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUCB1Q02818 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms