Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TTC1-201ENST00000231238 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SLC8A1-AS1-204ENST00000427354 790 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ASPA-202ENST00000456349 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms