Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MS4A2Q01362 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms