Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTA1P68133 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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