Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SKP1P63208 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SKP1P63208 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SKP1P63208 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms