Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HERVK_113P61574 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms