Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTBP2P56545 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms