Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMSP52788 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMSP52788 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMSP52788 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMSP52788 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMSP52788 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMSP52788 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms