Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSNK1EP49674 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms